基于z曲线理论的编码和非编码区序列分析.pdf

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争巾场也渗才易遏√≥他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得——ⅲ喝牧彳寺偷\独创声学位论文版权使用授权书明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其没有其他需要特别声明的,本栏可空蚱渌逃沟难换蛑な槭褂霉牟料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明学位论文作者签名:导师签字:本学位论文作者完全了解堂撞有关保留、使用学位论文的规定,有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅。本人授权堂撞可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。C艿难宦畚脑解密后适用本授权书签字日期:并表示谢意。月签字日期:年月同/一,
在又旧戏⒈硖馕!鞍┲⒀芯康淖U鄣阋蝗死嗷蜃榈娜蛄蟹治觥保第一章绪论人类基因组计划和模式生物基因组计划年达尔文进化论的发表和年孟德尔遗传定律的发现,是十九世纪生命科学发展的里程碑,年菪峁鼓P偷奶岢龊闐重组技术的的诞生,则开辟了二十世纪分子生物学和现代生物技术的新纪元。被誉为“生命科学阿波罗计划”的人类基因组计划于年开始实施,这一耗资亿美元的工程旨在测定人类基因组亿碱基序列,发现人类所有的基因,确定它们在染色体上的位置及功能,破译全部遗传信息,使人类第一次在分子水平上全面地认识自我。年眨鞴蒲Ъ夜ú剂巳死嗷蜃楣ぷ鞑萃迹年国际人类测序协作组宣布人类基因组测序图绘制成功,是生命科学发展的又一个里程碑,标志着人类基因组时代的正式来临。随着生物信息学的迅速发展以及庑蚣际跏笛槭侄蔚牟欢辖胶腿死基因组及模式生物基因组大规模测序的顺利实施,迄今为止已有四百多种原核生物完成测序。国际三大核酸序列数据库:珽虳男蛄惺亢碱基个数也在呈指数增长,同时国际上著名的蛋白质数据库如琒—和戎械牡白灾适坑隓序列也同步呈指数增长。如何分析这些数据,从中获得生物结构、功能等的相关信息是后基因组时代的首要任务。但以前国内外主要从事的是对于蛋白质编码区相关问题的研究。由于高等真核生物,特别是人的基因组中非编码区占有高达%一%⋯种遗传语言,遗传信息不仅体现在编码序列之中,而且隐含在非编码序列之中。例如,人的大量基因和非编码区还没有完仑定位,所以对非编码区的研究是后基因组时代的巨大挑战。而对于非编码区的研究,一个最基本的工作就是它的碱基组分分析。本论文主要研究内容就是非编面马区序列的几何学分析和非编码基因的识别。年,著名生物学家、诺贝尔奖获得者雷纳托杜尔贝科山东师范大学硕士学位论文
的短文,率先提出“人类基因组计划出要从整体上研究和分析整个人类基因组及其序列。计划于年正式启动,这一价值亿美元的计划的目标是,为亿个碱基对构成的人类基因组精确测序,从而最终弄清楚每种基因制造的蛋白质及其作用。年轮泄褡技入人类基因组计划,负责测定人类基因组全部序列的ィ簿褪号染色体上的万个碱基对,使中国成为继美、英、日、德、法之后第六个国际人类基因组计划参与国,也是参与这一计划的唯一发展中国家。在美国时间年月日,美、英、日、法、德和中国科学家宣布共同绘制完***类基因组序列图,跨越年的国际人类基因组计划提前收工。这是继发现菪峁之后生命科学领域的又一里程碑,标志着人类基因组时代的正式来临。严格地说,已宣布完成的人类基因组序列甚至还谈不上是“全书”,它覆盖了人类基因组所含基因区域的%,所剩ノO钟胁庑蚣际跷薹ń饩龅牟糠帧R恍┛蒲Ъ页疲补上这缺少的ヒ残砘挂;ㄉ蟣甑墓し颉K孀湃死嗷蜃橹鸾ケ黄埔耄~张生命之图将被绘就,预示着后基因组时代即将到来,基因药物已经走进人们的生活,利用基因治疗更多的疾病不再是一个奢望。因为随着我们对人类本身的了解迈上新的台阶,很多疾病的病因将被揭开,药物就会设计得更好些,治疗方案就能“对因下药钇鹁印⒁诚肮哂锌赡芨莼蚯榭鼋械髡死的整体健康状况将会提高,二十一世纪的医学基础将由此奠定【引。模式尘物基因组计划是人类基因组计划的一个重要组成部分,是人类基因组计划的必要补充并对其研究有很大的促进作用。由于人类对自身理解的限制、实验的限制和伦理学的制约,医学、生物学的研究在很大程度上依赖于对一些模式生物的研究。因此,一些与人类基因有相似性,但结构和基因组成都相对比较简单的生物体就成为进行人类基因组研究的绝好样本,即为人类基因组研究提供参照,对这些模式生物的基因组进行分析,这就是模式生物基因组计划。模式生物基因组计划最初确定的模式生物有:大肠杆菌、酵母、拟南芥、线虫、果蝇和小虺艸鼠等共六种【浚哉庑┐τ谏镅莼煌锥蔚纳锾宓难芯渴侨鲜度死嗷蜃结构和功能绝对不可缺少的,在后来的发展中逐渐加入了其